深圳高新企業(yè)認定涉及企業(yè)的方方面面，在實際申報過程中也會遇到各式各樣的問題，根據(jù)以往實操經(jīng)驗，我們從8大模塊中總結(jié)了以下幾點常見問題，僅供參考，盡量避免。
一、知識產(chǎn)權
1、申請的知識產(chǎn)權類型與企業(yè)產(chǎn)品服務不符、獲取時間不符合高新要求；2、高新企業(yè)認定提出申請時，專利暫未獲得授權，僅處于受理中；3、專利僅有授權通知書，無繳費單據(jù)，無法證明專利權處于法律保護狀態(tài)；4、非自有專利未辦理轉(zhuǎn)讓手續(xù)；5、轉(zhuǎn)讓的專利無原專利證書復印件或國家知識產(chǎn)權局出具的所有權轉(zhuǎn)讓證明，無法判斷原專利獲取時間和所有權人。
二、研發(fā)費用
1、研發(fā)費用核算不清、輔助賬不完整、不規(guī)范或暫未建立。需按《高新技術企業(yè)認定工作指引》相關要求編制研發(fā)費用輔助賬，歸集研發(fā)費用；2、研發(fā)費用真實性存疑，研發(fā)費大于管理費或占比過高；3、研發(fā)費歸集不合理，如研發(fā)人員人員年均費用遠低于一般人員水平，直接投入占研發(fā)費總額的比例過高，不同研發(fā)項目支出金額、結(jié)構(gòu)完全一樣；4、委托外部研發(fā)的支出全額計入研發(fā)費，未按80%計入研發(fā)費；5、研發(fā)費用中其他費用占比超過20%；6、研發(fā)費用明細表和研發(fā)項目（RD）表不一致；7、委托外部研發(fā)支出與附件材料產(chǎn)學研合作協(xié)議所列不一致，如某研發(fā)項目為產(chǎn)學研合作項目，但該項目研發(fā)結(jié)構(gòu)明細表中無委托外部研發(fā)支出；8、研發(fā)項目無證明材料，項目立項報告千篇一律，臨時拼湊。
三、高新技術產(chǎn)品收入
1、高新技術產(chǎn)品收入核算不清，歸集不規(guī)范。如總收入核算不準確，投資收益或營業(yè)外收入未計入總收入；2、高新技術產(chǎn)品不屬于領域目錄范圍；3、主要高新技術產(chǎn)品無知識產(chǎn)權關聯(lián)，或相關知識產(chǎn)權未授權，不在有效期。
四、科技成果轉(zhuǎn)化
1、無科技成果轉(zhuǎn)化匯總表，無法判斷成果項數(shù)；2、科技成果轉(zhuǎn)化附件材料混亂、裝訂無序，與成果轉(zhuǎn)化匯總表中所列不一致；3、科技成果轉(zhuǎn)化證明材料單一，僅有轉(zhuǎn)化效果證明材料，如銷售合同、發(fā)票，樣品圖片等，無科技成果技術證明材料。
五、科技人員
1、科技人員材料簡單，格式不規(guī)范，不符合要求，如無花名冊、名冊中無法判斷是否為科技人員；2、人員數(shù)據(jù)申請書和附件材料不一致；3、花名冊中科技人員占比不達標。
六、組織管理水平
1、組織管理水平材料混亂，未針對評價標準逐項提供；2、證明材料單一，多數(shù)為制度或文件，無執(zhí)行情況。如研發(fā)獎勵僅有制度，無落實情況。
七、財務會計報告
1、財務會計報告不完整，僅提供正文和會計報表，無附注；2、會計報表中各年度數(shù)據(jù)不一致，且無差異情況說明。如2015年報表中上年數(shù)據(jù)與2014年報表中期末數(shù)據(jù)不一致；3、會計報表附注披露的管理費科目明細中無研發(fā)費用數(shù)據(jù)，或披露的研發(fā)費用數(shù)據(jù)與專項審計報告中研發(fā)費用數(shù)據(jù)不一致，差異較大；4、含子公司的企業(yè)會計報表為公司合并報表，含子公司數(shù)據(jù)。
八、高新專項審計報告
1、高新專項審計報告不完整，無編制說明；2、高新專項審計報告所附表格不規(guī)范，未按規(guī)定的樣式列示。如未分年度、分項目列示、所附表格單位為元，按要求應為萬元，保留兩位小數(shù)；3、高新專項審計報告中計算研發(fā)費占比，高新技術產(chǎn)品收入占比時，銷售收入、總收入口徑錯誤，銷售收入應為主營業(yè)務收入和其他業(yè)務收入之和，總收入是收入總額減去不征稅收入；4、高新專項審計報告中研發(fā)項目支出與申報材料中所附研發(fā)費輔助明細賬不一致；5、財務報表數(shù)據(jù)、稅務系統(tǒng)中報稅數(shù)據(jù)、專項審計報告數(shù)據(jù)，三者不一致，差異較大。
